10月13日,由邦勤资本、国药励展联合主办,中原科技城、松山湖科学城协办的“2024医疗器械核心技术论坛”在深圳成功举办,论坛期间,深圳赛陆医疗科技有限公司联合创始人兼首席科学家王谷丰教授带来《从下一代测序(NGS)到下一代生物学技术》的主题分享。 下一代测序技术是21世纪生命科学研究的里程碑式突破,改变了我们对基因信息的获取方式。它为疾病诊断、个性化医疗、物种多样性研究乃至合成生物学等领域开辟了广阔天地。 ![]() ![]() 1、关于赛陆
赛陆医疗专注于测序技术及相关生物学技术的创新,拥有测序仪和基于二代测序技术的创新技术产品线,包括空间组学、芯片等。公司成立三年多,员工200多名,拥有1万多平方米的研发空间,产品覆盖低通量到高通量测序仪及空间组学产品,是全球前三家可以覆盖全通量测序公司之一。 ![]() 2、二代测序,大有可为 二代测序市场稳步增长,传统应用包括肿瘤、病源检测,新兴应用如单细胞测序、合成生物学等呈现爆发性增长,这也是我们三年前决定创业做测序仪的原因。 ![]() 3、二代测序技术的挑战
测序酶对序列具有偏好性,导致在某些位置错误频率高于平均水平,从而影响测序的准确性和可靠性。 ![]() 4、AI在测序中的应用
基于AI驱动的测序酶设计,赛陆已经筛选了超过100种测序酶,可以满足高保真、长读长的测序需求。 ![]() 通过对酶和边合成边测序碱基原料的适配,赛陆的测序平台假阳位点数是所有测序平台中最优的,比国际龙头企业的产品低了约一个数量级,真实地实现了对国际先进水平的超越。
![]() 5、赛陆测序仪特点:快、准、长、衡
赛陆通过技术积累与创新,如采用了高保真测序酶、创新测序芯片,所开发的测序仪产品具有快、准、长、衡的特点。 快:SE50低通量测序仅需3.5小时就可以下机。 准:极高的准确率,q40大于80%。 长:创新的测序酶,可以做到PE400、SE500测序。 衡:对于碱基极不平衡地全基因组甲基化测序表现优异,测序原始数据质量不仅达到了行业标杆,更在多个关键指标上表现优秀。 6、赛陆空间组学产品:高分辨率、高探针密度 生物学技术发展一般会有两个方向,深度和广度。深度可以是分辨率,从细胞到单分子,单分子成像改变了人类研究生物学的方法,从以前跑胶研究分子之间相互作用,到现在可以直接观察生物分子在体内怎么发挥作用。 王教授以前做过单分子成像的工作,做到后来经常有力不从心的感觉,因为生物学的过程通常都是非常复杂的,不是一种分子,是几十种、上百种分子。另一个维度上,人们可以把组织打烂,研究所有的分子,得到基因组,蛋白组等多组学的海量信息,人们得到了通量,但失去了分辨率,所以生物学下一步的发展方向必然经历分辨率和通量的结合,而空间组学就具有这个特点,它就像一个超级显微镜,可以看到所有的分子的位置及相互作用的网络。 ![]() 赛陆利用捕获芯片技术,实现了高分辨率和高探针密度的空间组学分析产品,其核心就是捕获芯片,芯片表面通过原位扩增的技术种植上高密度探针簇,探针簇的大小和密集程度决定了分辨率的高低,而探针簇的表面浓度决定了检测方法的灵敏度。探针簇由随机生成的空间条形码序列SBC、UMI序列和Poly T序列等核心序列组成,通过解析空间条码序列与坐标位置的映射关系,得到带有序列信息的空间转录组芯片。使用时,将组织铺到芯片上,裂解捕获以后进行逆转率,然后进行收割建库测序,最后构建空间转录组图谱。
赛陆的空间组学产品可以做到行业顶尖的1um分辨率,探针密度高达1.8万根/平方微米,是目前所有报道中最高的。 ![]() 此外捕获探针灵活可调,不仅可以用来捕获mRNA,还可以用来特定序列,实现转录组与空间16S、ATAC共检等。
![]() ![]() 赛陆空间转录组支持5-100um多级bin尺寸分析,在饱和度相同的情况下,捕获的UMI是竞品的数倍。这里展示一些在进行中的项目,相关论文会陆续发表。 ![]() ![]() 7、互动交流
问:王老师之前在北卡做教授,现在进入工业界,是否有将多年的研究成果导入到现有的产品? 答:化学系统、仪器系统和算法系统是测序仪的三大核心,之前在大学从事的表面化学、光学、算法的研究,在产品开发中也都有借鉴。 问:赛陆从正式运营至今只有3年时间,推出了3款测序仪和空间组学产品,还获得了国家高新和小巨人资质,您觉得是什么驱动我们如此高产高效? 答:所有的事情都是人做的,所以最大的因素还是找对人。测序仪开发涉及光学、芯片、硬件、软件、算法等12大方向,如何在较短的时间内把各个领域的人才聚集起来是非常不容易的。此外过往的经验很重要,帮助我们少踩坑,少走弯路。 |